MySQLで「暗号化」と主語を広くした場合、そこにはいくつかの定石があります。
MySQL Community Edition(GPL版)とその他のOSSを組み合わせて2026年に使える/選べる手順書紹介します。 これはひょっとしたらRDS for MySQLとかでも使えるかもしれませんというかほぼ使えると思います。